L'objectif du plan est de rationnaliser les activités portuaires et de les harmoniser avec les activités urbaines.
Le projet prévoit 3 opérations principales :

- La sécurisation du Margonajo dédié aux navires passagers
- Le transfert des dépotages de pétrole et de gaz au Ricanto 
- Le transfert de l'activité fret à Saint Joseph

Ces aménagements auront du sens d'autant plus qu'ils seront réalisés conjointement aux travaux d'aménagement du quartier gare amirauté toujours en gestation et associés à la révision du plan de déplacement urbain de la ville d'Ajaccio dans le cadre d'un projet multimodal satisfaisant.